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真核/原核無(wú)參mRNA-Seq，項(xiàng)目介紹；測(cè)序使用Illumina Xten平臺(tái)，測(cè)序原始數(shù)據(jù)質(zhì)控后進(jìn)行拼接，并進(jìn)一步對(duì)拼接所得轉(zhuǎn)錄本進(jìn)行功能注釋、CDD、CDS分析，SNP分析，SSR標(biāo)記開(kāi)發(fā)等分析。在計(jì)算基因的表達(dá)量后，進(jìn)行基因表達(dá)差異及差異基因GO、KOG（原核生物為COG）、KEGG功能富集分析，KEGG pathway等分析。對(duì)于多個(gè)樣本，可進(jìn)行重復(fù)相關(guān)性檢查、共表達(dá)分析、PCA主成分分析。另外，還可以進(jìn)行基因功能互作、蛋白網(wǎng)絡(luò)互作等分析，深入研究基因功能，進(jìn)一步揭示基因間互作網(wǎng)絡(luò)等信息，為研究網(wǎng)絡(luò)調(diào)控機(jī)理提供方向。 截止目前為止，生工生物可是為數(shù)不多的同時(shí)擁有ChromiumController和ChromiumX平臺(tái)的公司。上海市l(wèi)ncRNA高通量測(cè)序服務(wù)

生工優(yōu)勢(shì)：1.生工高通量測(cè)序部擁有豐富的樣品處理經(jīng)驗(yàn)，日均處理樣品200余例，涵蓋污泥、糞便、海底沉泥、水體濾膜、植物組織、動(dòng)物組織/細(xì)胞等樣品，省去您處理樣品的繁瑣過(guò)程。2.生物信息分析經(jīng)驗(yàn)豐富，可以滿足客戶標(biāo)準(zhǔn)分析到定制分析作圖的需求。且生工一直秉持只要生工已經(jīng)標(biāo)準(zhǔn)化的分析內(nèi)容（以生工分析報(bào)告模板為準(zhǔn)），全部無(wú)費(fèi)用。3.生工生物擁有生命科學(xué)領(lǐng)域較全的產(chǎn)品及服務(wù)體系，可以承接從分子到蛋白各個(gè)層級(jí)的實(shí)驗(yàn)項(xiàng)目。一站式解決問(wèn)題。上海生工生物 高通量測(cè)序技術(shù)如果你的樣品是質(zhì)粒或者是菌液，那為什么不試試我們的KBSeq呢？

生工高通量測(cè)序樣品要求，環(huán)境樣品：如果是新鮮土壤/污泥樣品，可以以冰袋運(yùn)輸，不超過(guò)3天;如果是凍存過(guò)的樣品（-20°C或者-80°C冰箱保存），為避免反復(fù)凍融，建議用足量的干冰（根據(jù)經(jīng)驗(yàn)，在秋冬季節(jié)，如果打包合適，3公斤塊狀干冰可以維持30-40小時(shí)）寄送;如果是水體樣品，建議采用濾膜過(guò)濾后，將濾膜寄送來(lái)生工。生工不負(fù)責(zé)過(guò)濾。要求濾膜3張，冰袋運(yùn)輸，不超過(guò)3天。其余特殊環(huán)境樣品，具體咨詢生工高通量測(cè)序部。

DNA樣品：請(qǐng)?zhí)峁╇娪灸z圖，濃度>20 ng/μl，總量一般1～2 μg。乙醇沉淀DNA或凍干DNA，可冰袋運(yùn)輸，不超過(guò)3天。

AO/PI染色原理：吖啶橙（AO）是一種小分子染料，可以通過(guò)完整的細(xì)胞膜，嵌入所有細(xì)胞（活細(xì)胞和死細(xì)胞）的細(xì)胞核，呈現(xiàn)綠色熒光；碘化丙啶（PI）只能通過(guò)不完整的細(xì)胞膜，即死細(xì)胞的細(xì)胞膜，嵌入所有死細(xì)胞的細(xì)胞核，呈現(xiàn)紅色熒光，通過(guò)標(biāo)記出的綠色熒光和紅色熒光就可以辨別出活細(xì)胞和死細(xì)胞，這種特異性染色的方法也可以排除無(wú)核細(xì)胞、雜質(zhì)、碎片等的干擾。熒光細(xì)胞計(jì)數(shù)儀檢測(cè)結(jié)果可以讓我們直觀的看到：細(xì)胞濃度（總細(xì)胞，活細(xì)胞，死細(xì)胞）、細(xì)胞存活率（臺(tái)盼藍(lán)和雙熒光AO/PI染色）、細(xì)胞平均直徑、細(xì)胞聚團(tuán)率、細(xì)胞直徑分布等結(jié)果的展示。KBSeq全質(zhì)粒測(cè)序只能測(cè)菌液和質(zhì)粒，像PCR產(chǎn)物什么的還是送一代測(cè)序吧。

生工高通量測(cè)序樣品要求，RNA樣品：請(qǐng)?zhí)峁舛取?50 ng/μl、總量≥2μg的總RNA樣品，樣品請(qǐng)去蛋白并進(jìn)行DNase處理;請(qǐng)務(wù)必提供每個(gè)樣品具體的濃度、體積、制備時(shí)間以及物種來(lái)源。比較好附上QC數(shù)據(jù)，可以是電泳膠圖、分光光度值、Nanodrop儀器檢測(cè)數(shù)據(jù)或者Agilent Bioanalyzer儀器檢測(cè)數(shù)據(jù)等;一般情況下，轉(zhuǎn)錄組測(cè)序需要Agilent Bioanalyzer儀器檢測(cè)獲得的總RNA 28S:18S≥1，RIN≥7;小RNA測(cè)測(cè)序不可采用常規(guī)柱式總RNA提取試劑盒，可選擇傳統(tǒng)總RNA提取法（如乙醇沉淀、異丙醇沉淀等）或者選用專(zhuān)門(mén)的小RNA提取試劑盒;寄送RNA樣品請(qǐng)置于1.5 ml離心管中，管上注明樣品名稱、濃度以及制備時(shí)間，管口使用Parafilm封口。在運(yùn)輸前將所有樣品管固定于50 ml帶蓋離心管中，再將50 ml管放在封口袋中。使用足量的干冰運(yùn)輸，并且盡量選用較快的郵遞方式，以降低運(yùn)輸過(guò)程中樣品降解的可能性。Illumina HiSeq2500/4000 可以運(yùn)行PE150/PE250模式。上海市高通量測(cè)序公司

生工一直秉持只要生工已經(jīng)標(biāo)準(zhǔn)化的分析內(nèi)容（以生工分析報(bào)告模板為準(zhǔn)），全部無(wú)費(fèi)用。上海市l(wèi)ncRNA高通量測(cè)序服務(wù)

全基因組測(cè)序是對(duì)未知基因組序列的物種進(jìn)行個(gè)體的基因組測(cè)序，其研究主要包括3個(gè)方面：第一種為不參考任何現(xiàn)有序列從頭組裝測(cè)序，是對(duì)未知基因組序列的物種進(jìn)行基因組測(cè)序，并綜合利用不同測(cè)序技術(shù)和生物信息學(xué)工具對(duì)研究物種進(jìn)行序列拼接和修正，進(jìn)而獲得該物種的基因組序列圖譜；第二種為常見(jiàn)的全基因組重測(cè)序，是對(duì)已知基因組序列的物種進(jìn)行個(gè)體或群體的測(cè)序研究，建立一個(gè)測(cè)序文庫(kù)進(jìn)行單個(gè)個(gè)體或不同個(gè)體混合池測(cè)序，發(fā)現(xiàn)遺傳變異標(biāo)記，進(jìn)行后續(xù)的研究；第三種是在已有參考基因組序列圖譜的基礎(chǔ)上，對(duì)不同品種的具有代表性個(gè)體建立多個(gè)文庫(kù)進(jìn)行全基因組從頭組裝測(cè)序，此方法能夠進(jìn)一步的進(jìn)行參考基因組的修補(bǔ)和發(fā)現(xiàn)短序列比對(duì)難以發(fā)現(xiàn)的遺傳變異。生工生物擁有眾多生物信息分析人才，可進(jìn)行專(zhuān)業(yè)的項(xiàng)目分析，為客戶提供個(gè)性化服務(wù)。上海市l(wèi)ncRNA高通量測(cè)序服務(wù)

生工生物工程（上海）股份有限公司是一家有著雄厚實(shí)力背景、信譽(yù)可靠、勵(lì)精圖治、展望未來(lái)、有夢(mèng)想有目標(biāo)，有組織有體系的公司，堅(jiān)持于帶領(lǐng)員工在未來(lái)的道路上大放光明，攜手共畫(huà)藍(lán)圖，在上海市等地區(qū)的醫(yī)藥健康行業(yè)中積累了大批忠誠(chéng)的客戶粉絲源，也收獲了良好的用戶口碑，為公司的發(fā)展奠定的良好的行業(yè)基礎(chǔ)，也希望未來(lái)公司能成為*****，努力為行業(yè)領(lǐng)域的發(fā)展奉獻(xiàn)出自己的一份力量，我們相信精益求精的工作態(tài)度和不斷的完善創(chuàng)新理念以及自強(qiáng)不息，斗志昂揚(yáng)的的企業(yè)精神將**生工生物工程供應(yīng)和您一起攜手步入輝煌，共創(chuàng)佳績(jī)，一直以來(lái)，公司貫徹執(zhí)行科學(xué)管理、創(chuàng)新發(fā)展、誠(chéng)實(shí)守信的方針，員工精誠(chéng)努力，協(xié)同奮取，以品質(zhì)、服務(wù)來(lái)贏得市場(chǎng)，我們一直在路上！