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10XVisium的實驗主要分為兩部分：組織學(xué)板塊和組學(xué)板塊。組織學(xué)板塊包括樣品的包埋、切片、固定、染色及成像，記錄切片的形態(tài)學(xué)信息；組學(xué)板塊包括cDNA的合成、擴增、接頭連接和測序，記錄切片的轉(zhuǎn)錄本信息和空間位置信息。具體實驗流程如下：A、切片制備和優(yōu)化：取新鮮組織、冷凍、切片，并進行HE染色成像，優(yōu)化確定切片是否覆蓋靶向區(qū)域。B、切片固定和透化：將組織切片放置在含有與RNA結(jié)合捕獲探針的載玻片上，并進行固定和透化，使細胞中的mRNA得到釋放，并結(jié)合到相應(yīng)的捕獲探針上，從而獲取基因表達信息。C、逆轉(zhuǎn)和文庫構(gòu)建：以捕獲的RNA為模板，進行cDNA合成，和測序文庫制備。D、高通量上機測序：對制備好的測序文庫，進行二代高通量短讀長測序。E、數(shù)據(jù)可視化分析：結(jié)合HE結(jié)果，確定哪些基因有表達，表達量高低，以及這些基因的空間位置信息助力探索生命時空多維度的動態(tài)變化的生物學(xué)信息；助力生命健康醫(yī)療大時代！西安高通量測序空間轉(zhuǎn)錄組商業(yè)化服務(wù)

當前的技術(shù)主要有四種策略：1、基于組學(xué)實驗結(jié)合空間重建的計算策略這種計算方法可以充分利用內(nèi)在基因表達模式或共表達的趨勢，從單個細胞的大量轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)中重構(gòu)細胞間的環(huán)境。然而，這些推論方法在某些情況下只呈現(xiàn)空間趨勢或特定組織的總體布局。2激光切割與NGS測序結(jié)合的策略基于LCM的轉(zhuǎn)錄組學(xué)或基因組學(xué)成功地獲得了單個細胞的空間轉(zhuǎn)錄組，盡管其通量很低，但是在可以標記成千上萬個單個細胞位買的多路復(fù)用條形碼策路可行之前，將少量細胞的數(shù)據(jù)粗略地整合到構(gòu)成組織的巨大背景中，可能具有一定價值。3、基于熒光物質(zhì)原位的轉(zhuǎn)錄組學(xué)基于圖像的原位轉(zhuǎn)錄組學(xué)在很大程度上增加了可檢測區(qū)域，但也存在一些問題，例如幾種smFISH方法很難從包括信號干擾、轉(zhuǎn)錄本積累等復(fù)雜背景中提取單個細胞。4、基于身核苷酸的空間條碼加上NGS測序。青島BD空間轉(zhuǎn)錄組商業(yè)化服務(wù)烈冰生物成立于2010年，專注于空間轉(zhuǎn)錄組測序領(lǐng)域科研服務(wù)。

所謂的高通量測序技術(shù)，又名大規(guī)模平行測序，是將DNA（或者cDNA）隨機片段化、加接頭，制備測序文庫，通過對文庫中數(shù)以萬計的克隆(colony)進行延伸反應(yīng)，檢測對應(yīng)的信號并獲取序列信息。與傳統(tǒng)測序法相比，高通量測序技術(shù)在處理大規(guī)模樣品時具有強大的優(yōu)勢，又快（兩天）又多（數(shù)百萬克?。蔀槟壳敖M學(xué)研究的主要技術(shù)。空間轉(zhuǎn)錄組測序是一個系統(tǒng)的工程，開展項目前您可能會先評估它提供的見解是否與您的研究問題相匹配，如果匹配，實驗過程如何規(guī)劃，實驗平臺如何選擇，樣本如何制備，數(shù)據(jù)如何分析等等，而在這一切開始之前，我們的服務(wù)就已經(jīng)開始了，從銷售到實驗到專業(yè)技術(shù)支持，我們開通全線對接渠道，幫助您快速定位項目訴求，提供從實驗設(shè)計到文章發(fā)表的全流程，我們始終是您貼心的科學(xué)合作伙伴。

烈冰科技自主研發(fā)的單細胞云平臺致力于幫助每一位客戶定制化分析數(shù)據(jù)，深入解讀數(shù)據(jù)分析結(jié)果，深入挖掘其背后的生物學(xué)意義；從操作便捷、結(jié)果可視化、分析可追溯、系統(tǒng)穩(wěn)定等方面助力單細胞研究，加速科研進程！此外，烈冰生信團隊根據(jù)豐富的實戰(zhàn)經(jīng)驗為用戶量身打造了一款單細胞測序結(jié)果解讀的神兵利器——單細胞瀏覽器（SingleCellBrowser），不僅可以將海量復(fù)雜的結(jié)果文件可視化，還可以實現(xiàn)分析結(jié)果的三維立體化的展示呈現(xiàn)。專業(yè)的生信代碼交給專業(yè)的烈冰，專業(yè)的生物學(xué)意義交給專業(yè)的您！烈冰空間轉(zhuǎn)錄組，多平臺任意選擇，隨心組合，優(yōu)化您的科學(xué)研究，助力探索新的科學(xué)視角。

相比于常規(guī)的測序手段，空間轉(zhuǎn)錄組測序有幾個明顯的優(yōu)勢：1.將轉(zhuǎn)錄組信息與空間信息對應(yīng)，體現(xiàn)組織內(nèi)部的異質(zhì)性：每個區(qū)域獨特的條形碼使測序結(jié)果與空間位置形成一一對應(yīng)關(guān)系。雖然暫時還無法精細到單細胞層面，但是這樣的區(qū)域劃分也已經(jīng)足以展現(xiàn)出組織內(nèi)部不同區(qū)域間的轉(zhuǎn)錄組差異。2.不影響對全組織進行分析：芯片上捕獲的全轉(zhuǎn)錄組在同一個反應(yīng)中完成測序，能有效降低多次重復(fù)實驗中的誤差。測序結(jié)果如果不按照條形碼歸類，則直接體現(xiàn)的是切片全組織的轉(zhuǎn)錄組情況，無需再做單獨檢測。3.為進一步的研究提供指導(dǎo)意見：常規(guī)的轉(zhuǎn)錄組測序，對后續(xù)實驗的指導(dǎo)仍然停留在全組織層面。而空間轉(zhuǎn)錄組測序則可以標識出更有價值的研究區(qū)域，引導(dǎo)研究者將組織進一步細分。烈冰專精空間轉(zhuǎn)錄組測序領(lǐng)域。深圳空間轉(zhuǎn)錄組

十二年測序經(jīng)驗，烈冰生物空間轉(zhuǎn)錄組領(lǐng)域的佼佼者。西安高通量測序空間轉(zhuǎn)錄組商業(yè)化服務(wù)

轉(zhuǎn)錄組分析指對細胞內(nèi)所有轉(zhuǎn)錄產(chǎn)物的分析。轉(zhuǎn)錄組測序一般是對用多聚胸腺嘧啶（oligo-dT）進行親和純化的RNA聚合酶II轉(zhuǎn)錄生成的成熟mRNA和ncRNA進行高通量測序。相對于傳統(tǒng)的芯片雜交平臺，轉(zhuǎn)錄組測序無需預(yù)先針對已知序列設(shè)計探針，即可對任意物種的整體轉(zhuǎn)錄活動進行檢測，提供更精確的數(shù)字化信號，是目前深入研究轉(zhuǎn)錄組復(fù)雜性的強大工具。FFPE空間轉(zhuǎn)錄組技術(shù)原理 為同時獲得空間表達和組織學(xué)背景信息,該方案首先將FFPE組織切片置于Visium基因芯片上進行組織學(xué)染色和成像,然后利用切片下方Visium基因芯片上的探針進行表達定量。西安高通量測序空間轉(zhuǎn)錄組商業(yè)化服務(wù)

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