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溫州烈冰科技空間轉(zhuǎn)錄組商業(yè)化服務(wù)

基因測序是基因檢測的方法之一,其又叫基因譜測序,是國際上公認(rèn)的一種基因檢測標(biāo)準(zhǔn)。高通量測序技術(shù)是對傳統(tǒng)測序一次顛覆性的改變,一次對幾十萬到幾百萬條核酸序列進(jìn)行測定,被稱為下一代測序技術(shù)(nextgenerationsequencing),足見其劃時(shí)代的改變,同時(shí)高通量測序使得對一個(gè)物種的轉(zhuǎn)錄組和基因組進(jìn)行細(xì)致全貌的分析成為可能,所以又被稱為深度測序(deepsequencing)?;驕y序相關(guān)產(chǎn)品和技術(shù)已由實(shí)驗(yàn)室研究逐漸演變到臨床應(yīng)用,可以說,基因測序技術(shù)將是下一個(gè)改變世界的技術(shù)。高通量測序技術(shù)是對傳統(tǒng)測序一次翻天覆地的改變,一次對幾十萬到幾百萬條核酸序列進(jìn)行測定。溫州烈冰科技空間轉(zhuǎn)錄組商業(yè)化服務(wù)

空間轉(zhuǎn)錄組研究的的必耍性:研究單細(xì)胞是想要探究細(xì)胞間的異質(zhì)性,但是常規(guī)的單細(xì)胞是將細(xì)胞解離成單細(xì)胞懸液,然后利用單細(xì)胞分離技術(shù)(微孔,微板,液滴)等方法實(shí)現(xiàn)單細(xì)胞建庫,這里比較大的問題是是細(xì)胞失去了原本在組織的空間信息。然而這個(gè)空間信息在實(shí)際研究中是非常重要。特別是在研究細(xì)胞命運(yùn)機(jī)制及細(xì)胞譜系發(fā)生空間位置的信息顯得尤為重要,因此發(fā)展空問轉(zhuǎn)錄組技術(shù)實(shí)現(xiàn)細(xì)胞的位置信息的保留,對研究此類細(xì)胞狀態(tài)尤為必要。深圳烈冰生物空間轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)分析可視化烈冰一站式多平臺(tái)測序服務(wù):立足科學(xué)研究,解碼生命本質(zhì)。

作為2019年的明星技術(shù)之一,10x Genomics單細(xì)胞測序憑借其高通量、低成本、易操作、穩(wěn)定性高等優(yōu)勢一直保持著高熱度,目前利用該平臺(tái)發(fā)表的文章已達(dá)500多篇。空間轉(zhuǎn)錄組技術(shù)優(yōu)勢:實(shí)現(xiàn)基因表達(dá)數(shù)據(jù)與空間定位信息的結(jié)合,解析多種類型組織切片樣本中基因表達(dá)譜;無需組織解離,保留組織結(jié)構(gòu)及細(xì)胞微環(huán)境,鑒定異質(zhì)性組織中細(xì)胞類型,避免相關(guān)偏好性;可用于挖掘新的組織生物標(biāo)記物;可與現(xiàn)行實(shí)驗(yàn)室組織分析方法輕松對接,短時(shí)間內(nèi)即可完成切片及文庫制備流程。

細(xì)胞中基因的表達(dá)是嚴(yán)格按照時(shí)間和空間順序發(fā)生,因此細(xì)胞類型和基因表達(dá)具有時(shí)間特異性和空間特異性。時(shí)間特異性可以通過收集不同時(shí)間點(diǎn)的樣本進(jìn)行單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組測序來分析。但是單細(xì)胞測序結(jié)果動(dòng)輒上百G數(shù)據(jù)量,龐大的數(shù)據(jù)對于分析平臺(tái)和分析能力有著很高的要求,單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組測序(scRNA-Seq)在單細(xì)胞懸液制備的過程中破壞了細(xì)胞的空間結(jié)構(gòu),無法給出固態(tài)異質(zhì)化組織中細(xì)胞空間排布信息。而空間轉(zhuǎn)錄組可以解決這個(gè)問題,其以點(diǎn)陣形式記錄組織切片細(xì)胞的空間信息??臻g轉(zhuǎn)錄組測序因其強(qiáng)大的探究疾病--細(xì)胞--基因的關(guān)系,一度成為高通量測序技術(shù)的“天花板”。

轉(zhuǎn)錄組分析指對細(xì)胞內(nèi)所有轉(zhuǎn)錄產(chǎn)物的分析。轉(zhuǎn)錄組測序一般是對用多聚胸腺嘧啶(oligo-dT)進(jìn)行親和純化的RNA聚合酶II轉(zhuǎn)錄生成的成熟mRNA和ncRNA進(jìn)行高通量測序。相對于傳統(tǒng)的芯片雜交平臺(tái),轉(zhuǎn)錄組測序無需預(yù)先針對已知序列設(shè)計(jì)探針,即可對任意物種的整體轉(zhuǎn)錄活動(dòng)進(jìn)行檢測,提供更精確的數(shù)字化信號(hào),是目前深入研究轉(zhuǎn)錄組復(fù)雜性的強(qiáng)大工具。FFPE空間轉(zhuǎn)錄組技術(shù)原理 為同時(shí)獲得空間表達(dá)和組織學(xué)背景信息,該方案首先將FFPE組織切片置于Visium基因芯片上進(jìn)行組織學(xué)染色和成像,然后利用切片下方Visium基因芯片上的探針進(jìn)行表達(dá)定量。空間轉(zhuǎn)錄組測序以分子方式定義病理,完成了病理數(shù)字化結(jié)合病理影像化的革新。濟(jì)南烈冰生物空間轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)分析

烈冰科技已建立了基于空間轉(zhuǎn)錄組的高通量測序?qū)嶒?yàn)多平臺(tái)。溫州烈冰科技空間轉(zhuǎn)錄組商業(yè)化服務(wù)

細(xì)胞在組織樣本中的相對空間位置關(guān)系對于了解疾病病理學(xué)非常重要。但是scRNA-Seq在單細(xì)胞懸液制備的過程中破壞了細(xì)胞的空間結(jié)構(gòu),無法給出固態(tài)異質(zhì)化組織中細(xì)胞空間排布信息。而空間轉(zhuǎn)錄組可以解決這個(gè)問題,通過記錄組織切片細(xì)胞的空間信息,捕獲組織切片中的組織學(xué)信息;通過免疫熒光進(jìn)行蛋白組檢測,將基因表達(dá)譜映射回組織樣本中的原始位置,同時(shí)獲得細(xì)胞/基因的空間表達(dá)特異性。該技術(shù)可以為神經(jīng)科學(xué),發(fā)育生物學(xué),免疫生理學(xué)等領(lǐng)域的研究提供組織和基因表達(dá)情況的新視角。溫州烈冰科技空間轉(zhuǎn)錄組商業(yè)化服務(wù)

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