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上海地區(qū)有參轉(zhuǎn)錄組高通量測(cè)序平臺(tái)

長(zhǎng)鏈非編碼RNA(lncRNA)測(cè)序(只限有參考基因組物種),項(xiàng)目介紹:長(zhǎng)鏈非編碼RNAs(Long non-coding RNAs,LncRNAs)是一類轉(zhuǎn)錄本長(zhǎng)度大于200 nt且不編碼蛋白質(zhì)的RNAs(不含rRNA),普遍存在于各種生物體內(nèi)。哺乳動(dòng)物基因組序列中4%~9%的序列產(chǎn)生的轉(zhuǎn)錄本是LncRNA(相應(yīng)的蛋白編碼RNA比例是1%)。近年來研究表明,LncRNA參與了多種重要的調(diào)控過程,如X染色體沉默、基因組印記及染色質(zhì)修飾等。通過LncRNA測(cè)序,可以快速獲得與其生物學(xué)過程或者疾病相關(guān)的LncRNA的表達(dá)變化,從而促進(jìn)LncRNA的深入研究。RNA樣品請(qǐng)用1.5 mL離心管裝好并用封口膜封好,并安置于50 mL離心管內(nèi)或其他類似容器里,并旋緊蓋子。上海地區(qū)有參轉(zhuǎn)錄組高通量測(cè)序平臺(tái)

KBSeq全質(zhì)粒測(cè)序跟一代測(cè)序相比有什么優(yōu)點(diǎn)呢?一代測(cè)序:1.數(shù)據(jù)質(zhì)量,套峰,雙峰等情況,需要人工分析校對(duì)。2.測(cè)序長(zhǎng)度,1 kb。3.成本,低。4.樣本用量,100 ng。5.精確度,70-90%。6.測(cè)序能力,需要測(cè)序引物,只能測(cè)測(cè)序引物間的片段序列。7.通量低,(與讀長(zhǎng)有關(guān))。8.實(shí)驗(yàn)周期,如果片段長(zhǎng)度超過5K,測(cè)通可能需要15天左右。對(duì)于測(cè)序長(zhǎng)度較長(zhǎng),如果我們用Sanger測(cè)序往往需要花費(fèi)大量的時(shí)間,而我們KBSeq全質(zhì)粒測(cè)序則只需要5-7天,就可以測(cè)通片段長(zhǎng)度小于30kb以下的片段。KBSeq全質(zhì)粒測(cè)序?qū)τ跇颖镜牧?,要求的也比較少,比如質(zhì)粒我們的樣本要求DNA的濃度需≥ 1 ng/μl, 體積需≥5 μl,如果比較珍貴的樣本或者是樣本比較難提取的,KBSeq就更為適合了。上海多重PCR高通量測(cè)序平臺(tái)準(zhǔn)確、迅速,可以說是KBSeq的代名詞了。

生工高通量測(cè)序樣品要求,組織/細(xì)胞樣品:請(qǐng)使用新鮮取樣的實(shí)驗(yàn)材料,當(dāng)場(chǎng)分成小塊后立即用液氮或干冰乙醇速凍,保存于-80°C冰箱,用足量的干冰(根據(jù)經(jīng)驗(yàn),在秋冬季節(jié),如果打包合適,3公斤塊狀干冰可以維持30-40小時(shí))寄送;于微生物樣品,請(qǐng)客戶如實(shí)聲明所屬物種,對(duì)于可能致病的微生物,生工保留拒收的權(quán)利;對(duì)于需要進(jìn)行RNA抽提的樣品,可以但不建議將組織在液氮中研磨后用TRIzol懸浮后用普通冰袋寄送,具體情況請(qǐng)先取得溝通。

生工人線粒體基因組測(cè)序(多重?cái)U(kuò)增法),項(xiàng)目介紹:生工生物高通量測(cè)序部采用多重?cái)U(kuò)增技術(shù),對(duì)人線粒體基因組進(jìn)行擴(kuò)增捕獲,并進(jìn)一步采用Illumina測(cè)序平臺(tái)進(jìn)行高通量測(cè)序。該技術(shù)方案可以快速擴(kuò)增到幾乎線粒體全長(zhǎng),并進(jìn)行高深度測(cè)序,下游提供常規(guī)比對(duì)篩查突變等生物信息分析??蛻籼峁悠奉愋停?.人來源DNA,濃度大于1ng/ul,總量大于20ng,以Qubit檢測(cè)結(jié)果為準(zhǔn)2.運(yùn)輸條件:冰袋運(yùn)輸。交付信息:1.測(cè)序原始數(shù)據(jù)交付實(shí)驗(yàn)報(bào)告2.測(cè)序原始數(shù)據(jù)3.突變分析結(jié)果。一臺(tái)10xGenomics Chromium X儀器能夠在單次運(yùn)行中分析數(shù)百至數(shù)十萬個(gè)細(xì)胞,讓百萬級(jí)的細(xì)胞研究變得常規(guī)。

對(duì)于微生物樣品,請(qǐng)客戶如實(shí)聲明所屬物種;對(duì)于可能致病的微生物,生工將拒收。以固體培養(yǎng)基培養(yǎng)的樣品,需將樣品從培養(yǎng)基上刮取下來,用干冰寄送;以液體培養(yǎng)基培養(yǎng)的樣品,需離心后棄培養(yǎng)液收集樣品,用RNA組織保存液(例如RNA-Be-Locker A)保存,以干冰或冰袋寄送;沒有RNA組織保存液的情況下,也可用液氮或干冰乙醇速凍,保存于-80°C 冰箱,埋于足量干冰寄送。***樣品送樣量需至少達(dá)到100 mg/樣;細(xì)菌樣品送樣量需至少達(dá)到107(10的7次方)數(shù)量級(jí),同時(shí),在與樣本一同寄送的送樣表上,標(biāo)明屬于革蘭氏陽(yáng)性菌(G+)還是革蘭氏陰性菌(G-)。使用足量的干冰運(yùn)輸,并且盡量選用較快的郵遞方式,以降低運(yùn)輸過程中樣品降解的可能性。上海市羥甲基化測(cè)序高通量測(cè)序測(cè)序

KBSeq全質(zhì)粒測(cè)序只能測(cè)菌液和質(zhì)粒,像PCR產(chǎn)物什么的還是送一代測(cè)序吧。上海地區(qū)有參轉(zhuǎn)錄組高通量測(cè)序平臺(tái)

擴(kuò)增子測(cè)序,項(xiàng)目介紹:隨著基因編輯技術(shù)(尤其是CRISPR-cas9技術(shù))的發(fā)展,科研人員使用傳統(tǒng)的Sanger測(cè)序技術(shù)無法快速有效鑒定基因編輯效率。但是,通過對(duì)靶基因區(qū)域附近設(shè)計(jì)引物,進(jìn)行PCR擴(kuò)增,并對(duì)PCR產(chǎn)物進(jìn)行高通量測(cè)序,可以快速高效的獲得目標(biāo)區(qū)域的突變頻率信息,尤其是對(duì)低頻突變的檢測(cè)效果遠(yuǎn)遠(yuǎn)優(yōu)于一代測(cè)序,性價(jià)比極高。16S全長(zhǎng)分類測(cè)序,項(xiàng)目介紹:16S全長(zhǎng)測(cè)序分析主要是對(duì) 16S rRNA基因全長(zhǎng)進(jìn)行擴(kuò)增,基于PacBio 測(cè)序平臺(tái)測(cè)序. 相比較二代測(cè)序只選擇 1-2 個(gè)高變區(qū)進(jìn)行測(cè)序,三代可以獲得全長(zhǎng)的 16S 序列,更多變異區(qū)信息可以提高物種鑒定的分辨率,還可以提高對(duì)于群落組成的鑒定的精度。另外,針對(duì)fungus/真核生物,也可以采用類似的辦法,擴(kuò)增ITS/18S全長(zhǎng),進(jìn)行物種分類測(cè)序,提高鑒定精度。上海地區(qū)有參轉(zhuǎn)錄組高通量測(cè)序平臺(tái)

生工生物工程(上海)股份有限公司匯集了大量的優(yōu)秀人才,集企業(yè)奇思,創(chuàng)經(jīng)濟(jì)奇跡,一群有夢(mèng)想有朝氣的團(tuán)隊(duì)不斷在前進(jìn)的道路上開創(chuàng)新天地,繪畫新藍(lán)圖,在上海市等地區(qū)的醫(yī)藥健康中始終保持良好的信譽(yù),信奉著“爭(zhēng)取每一個(gè)客戶不容易,失去每一個(gè)用戶很簡(jiǎn)單”的理念,市場(chǎng)是企業(yè)的方向,質(zhì)量是企業(yè)的生命,在公司有效方針的領(lǐng)導(dǎo)下,全體上下,團(tuán)結(jié)一致,共同進(jìn)退,**協(xié)力把各方面工作做得更好,努力開創(chuàng)工作的新局面,公司的新高度,未來生工生物工程供應(yīng)和您一起奔向更美好的未來,即使現(xiàn)在有一點(diǎn)小小的成績(jī),也不足以驕傲,過去的種種都已成為昨日我們只有總結(jié)經(jīng)驗(yàn),才能繼續(xù)上路,讓我們一起點(diǎn)燃新的希望,放飛新的夢(mèng)想!

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