2021年11月1日,在這個(gè)平凡而又特殊的日子里,生工生物高通量測(cè)序部迎來(lái)了一位新成員——10xGenomics Chromium X!不要看我們個(gè)頭小,我們可是百萬(wàn)級(jí)單細(xì)胞捕獲神器吆。X是如何實(shí)現(xiàn)單次運(yùn)行有這么高的吞吐量呢?多通道+高捕獲+10x的CellPlex多樣本混樣技術(shù)。X儀器本身有16個(gè)通道(Controller為8通道),每個(gè)通道比較多捕獲20000個(gè)細(xì)胞(Controller為10000個(gè)細(xì)胞)。再結(jié)合10x的CellPlex多樣本混樣技術(shù),每個(gè)通道比較多可捕獲60,000個(gè)細(xì)胞,去除雙細(xì)胞率后,每張芯片比較多可捕獲750,000個(gè)單細(xì)胞。RNA樣品建議用足量干冰運(yùn)輸。上海市18s高通量測(cè)序NGS
怎樣通過(guò)血球計(jì)數(shù)板進(jìn)行質(zhì)檢操作呢?將血球計(jì)數(shù)板擦拭干凈,取干凈的蓋玻片蓋在計(jì)數(shù)板上;將細(xì)胞懸液混勻(或10μl臺(tái)盼藍(lán)+10μl細(xì)胞懸液),吸出10μl懸液至計(jì)數(shù)板上蓋玻片的一側(cè)使細(xì)胞核懸液鋪滿蓋玻片和計(jì)數(shù)板之間;在顯微鏡下分別對(duì)V1/V2/V3/V4四個(gè)計(jì)數(shù)區(qū)域進(jìn)行計(jì)數(shù);按細(xì)胞計(jì)數(shù)公式進(jìn)行計(jì)算,計(jì)算公式:細(xì)胞總數(shù)={(V1+V2+V3+V4)/4}*10000*懸液體積*稀釋倍數(shù),V1/V2/V3/V4為各個(gè)計(jì)數(shù)區(qū)的細(xì)胞數(shù)目,細(xì)胞活率=活細(xì)胞數(shù)目/總細(xì)胞數(shù)目*100%?;蚪M高通量測(cè)序產(chǎn)品準(zhǔn)確、迅速,可以說(shuō)是KBSeq的代名詞了。
生工優(yōu)勢(shì):1.生工高通量測(cè)序部擁有豐富的樣品處理經(jīng)驗(yàn),日均處理樣品200余例,涵蓋污泥、糞便、海底沉泥、水體濾膜、植物組織、動(dòng)物組織/細(xì)胞等樣品,省去您處理樣品的繁瑣過(guò)程。2.生物信息分析經(jīng)驗(yàn)豐富,可以滿足客戶標(biāo)準(zhǔn)分析到定制分析作圖的需求。且生工一直秉持只要生工已經(jīng)標(biāo)準(zhǔn)化的分析內(nèi)容(以生工分析報(bào)告模板為準(zhǔn)),全部無(wú)費(fèi)用。3.生工生物擁有生命科學(xué)領(lǐng)域較全的產(chǎn)品及服務(wù)體系,可以承接從分子到蛋白各個(gè)層級(jí)的實(shí)驗(yàn)項(xiàng)目。一站式解決問題。
生工高通量測(cè)序樣品要求,組織/細(xì)胞樣品:請(qǐng)使用新鮮取樣的實(shí)驗(yàn)材料,當(dāng)場(chǎng)分成小塊后立即用液氮或干冰乙醇速凍,保存于-80°C冰箱,用足量的干冰(根據(jù)經(jīng)驗(yàn),在秋冬季節(jié),如果打包合適,3公斤塊狀干冰可以維持30-40小時(shí))寄送;于微生物樣品,請(qǐng)客戶如實(shí)聲明所屬物種,對(duì)于可能致病的微生物,生工保留拒收的權(quán)利;對(duì)于需要進(jìn)行RNA抽提的樣品,可以但不建議將組織在液氮中研磨后用TRIzol懸浮后用普通冰袋寄送,具體情況請(qǐng)先取得溝通。生工生物已開展10x單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組測(cè)序(scRNA-seq)服務(wù),如果正好您有需要,那就快快來(lái)call我們吧!
簡(jiǎn)化基因組測(cè)序,項(xiàng)目介紹:通過(guò)限制性內(nèi)切酶對(duì)基因組DNA進(jìn)行酶切,并對(duì)酶切片段進(jìn)行高通量測(cè)序,這種通過(guò)酶切降低基因組的復(fù)雜度的測(cè)序技術(shù)統(tǒng)稱為簡(jiǎn)化基因 組測(cè)序技術(shù)。利用生物信息學(xué)方法,進(jìn)行SNP單體型圖譜繪制,全基因組關(guān)聯(lián)分析(GWAS),連鎖分析和QTL定位分析,種群進(jìn)化,主成分分析等。比較有代表性的方法有GBS-seq和RAD-seq。宏全基因組測(cè)序,項(xiàng)目介紹:宏基因組指特定環(huán)境樣品內(nèi)全部遺傳物質(zhì)的總和。直接提取環(huán)境樣品內(nèi)全部基因組DNA,隨后進(jìn)行大規(guī)模高通量測(cè)序(shotgun 策 略)。測(cè)到數(shù)據(jù)后,先進(jìn)行必要的數(shù)據(jù)質(zhì)控,而后進(jìn)行基因組拼接、注釋(物種、基因功能),使得我們可以獲取環(huán)境樣品內(nèi)菌群分布、系統(tǒng)進(jìn)化、功能代謝等信息。該方法已經(jīng)得到普遍的運(yùn)用。DNA樣品請(qǐng)用1.5 mL離心管裝好并用封口膜封好,并安置于50 mL離心管內(nèi)或其他類似容器里,并旋緊蓋子。上海市l(wèi)ncRNA高通量測(cè)序項(xiàng)目
請(qǐng)?zhí)峁╇娪灸z圖,濃度>20 ng/μl,總量一般1~2 μg。乙醇沉淀DNA或凍干DNA,可冰袋運(yùn)輸,不超過(guò)3天。上海市18s高通量測(cè)序NGS
臺(tái)盼藍(lán)染色原理:臺(tái)盼藍(lán)染色原理:臺(tái)盼藍(lán)不能透過(guò)活細(xì)胞正常完整的細(xì)胞膜,故活細(xì)胞不被染色。而死細(xì)胞的細(xì)胞膜透性增高,可使染料進(jìn)入細(xì)胞內(nèi)而使死細(xì)胞染成淡藍(lán)色。
通過(guò)顯微鏡使用血球計(jì)數(shù)板質(zhì)檢得到質(zhì)檢結(jié)果:明場(chǎng)(細(xì)胞未染色):主要可以觀察懸液背景質(zhì)量(背景干凈,無(wú)雜質(zhì)碎片,無(wú)細(xì)胞團(tuán)塊);臺(tái)盼藍(lán)場(chǎng)(細(xì)胞與臺(tái)盼藍(lán)染色后):主要可以觀察活性(主要為活細(xì)胞,未染色藍(lán)色的為活細(xì)胞);通過(guò)臺(tái)盼藍(lán)場(chǎng)計(jì)算活率:90%>80%;細(xì)胞濃度:710cells/μl;等結(jié)果來(lái)看,血球計(jì)數(shù)板質(zhì)檢結(jié)果的展示可以看出所有指標(biāo)均符合上機(jī)標(biāo)準(zhǔn),屬于高質(zhì)量單細(xì)胞懸液。 上海市18s高通量測(cè)序NGS
生工生物工程(上海)股份有限公司是一家有著先進(jìn)的發(fā)展理念,先進(jìn)的管理經(jīng)驗(yàn),在發(fā)展過(guò)程中不斷完善自己,要求自己,不斷創(chuàng)新,時(shí)刻準(zhǔn)備著迎接更多挑戰(zhàn)的活力公司,在上海市等地區(qū)的醫(yī)藥健康中匯聚了大量的人脈以及**,在業(yè)界也收獲了很多良好的評(píng)價(jià),這些都源自于自身不努力和大家共同進(jìn)步的結(jié)果,這些評(píng)價(jià)對(duì)我們而言是比較好的前進(jìn)動(dòng)力,也促使我們?cè)谝院蟮牡缆飞媳3謯^發(fā)圖強(qiáng)、一往無(wú)前的進(jìn)取創(chuàng)新精神,努力把公司發(fā)展戰(zhàn)略推向一個(gè)新高度,在全體員工共同努力之下,全力拼搏將共同生工生物工程供應(yīng)和您一起攜手走向更好的未來(lái),創(chuàng)造更有價(jià)值的產(chǎn)品,我們將以更好的狀態(tài),更認(rèn)真的態(tài)度,更飽滿的精力去創(chuàng)造,去拼搏,去努力,讓我們一起更好更快的成長(zhǎng)!
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