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空間代謝組學(xué)（AFADESI-MSI）：中文標(biāo)題：使用敞開式質(zhì)譜成像技術(shù)及代謝組學(xué)繪制大鼠腦代謝網(wǎng)絡(luò)圖研究對象：大鼠腦發(fā)表期刊：AnalyticalChemistry影響因子：6.986發(fā)表時間：2021年4月23日研究單位：中國醫(yī)學(xué)科學(xué)院藥物研究所天然藥物活性物質(zhì)與功能國家重點實驗室運用生物技術(shù)：空間代謝組學(xué)（AFADESI-MSI）。大腦是結(jié)構(gòu)**復(fù)雜的***之一，主要功能與其微區(qū)的分子相互作用密切相關(guān)。大腦的小分子調(diào)節(jié)機制對理解***功能、精神疾病機理和藥物研發(fā)有很大的幫助。動物的認知過程和行為控制均依賴于腦部強大的***網(wǎng)絡(luò)——神經(jīng)連接體?？茖W(xué)家進行了很多研究，但是對腦部小分子網(wǎng)絡(luò)的研究仍有不足。黑龍江空間代謝組學(xué)英文空間代謝組學(xué),代謝組數(shù)據(jù)庫。

空間代謝組學(xué)助力醫(yī)科院藥物所蔣建東團隊探究靶向納米技術(shù)促進小檗堿肝臟吸收機制。中國醫(yī)學(xué)科學(xué)院藥物研究所蔣建東團隊課題組在NatureCommunications發(fā)表了題為“Liver-targetnanotechnologyfacilitatesberberinetoamelioratecardio-metabolicdiseases"的研究成果，通過AFADESI-MSI空間代謝組學(xué)、WesternBlotting、RT-PCR、Flowcytometry和ELISA等技術(shù)研究BBR-CTA-Mic對高脂飲食小鼠的代謝紊亂和******效果，發(fā)現(xiàn)BBR-CTA-Mic不僅可有效促進肝臟沉積和肝細胞攝取BBR，還能降低血漿中的脂質(zhì)和促炎細胞因子。

空間代謝組學(xué)研究作者對P493-6B細胞淋巴瘤系（BCL）進行了全基因組表達譜、核突變和ChIP分析，發(fā)現(xiàn)MYC誘導(dǎo)增加了包括ACLY、ACACA、FASN和SCD1及其相關(guān)蛋白在內(nèi)的脂肪酸（FA）合成基因的mRNA表達，在MYC誘導(dǎo)的肝細胞*（HCC）、急性白血病（T-ALL）和腎細胞*（RCC）的三種體內(nèi)轉(zhuǎn)基因小鼠模型中也有類似表達。還發(fā)現(xiàn)MYC與這些FA合成基因的啟動子結(jié)合并啟動mRNA轉(zhuǎn)錄，如甲羥戊酸和膽固醇途徑基因的啟動子。為了了解MYC和SREBP1之間的相互作用，作者首先，對這兩種蛋白進行ChIP和re-ChIP分析，證明MYC和SREBP1都可以發(fā)現(xiàn)與FA合成基因啟動子中的相同DNA分子結(jié)合（圖1）。SREBP1的敲低也降低了FA合成基因的表達，但不降低MYC基因的表達。其次，ChIP的MYC與啟動子結(jié)合，不僅調(diào)節(jié)FA合成基因的表達，還調(diào)節(jié)糖酵解和谷氨酰胺分解基因的表達。因此，MYC似乎會依次調(diào)節(jié)參與脂質(zhì)合成的基因：首先誘導(dǎo)葡萄糖和谷氨酰胺，然后誘導(dǎo)FA合成相關(guān)基因。通過RNA測序（RNA-seq）發(fā)現(xiàn)，增加MYC水平會引起糖酵解、谷氨酰胺分解和FA合成。空間代謝組學(xué) 技術(shù)咨詢中心。

鹿明生物空間代謝組學(xué)項目實測結(jié)果1、可實現(xiàn)代謝物定性數(shù)量：1000-3000個代謝物。2、定性代謝物類型：不噴涂基質(zhì)，小分子物質(zhì)檢測不被基質(zhì)抑制，定性物質(zhì)約70%為700Da以下的小分子物質(zhì)，30%為脂質(zhì)大分子。空間多組學(xué)聯(lián)合：空間代謝+空間轉(zhuǎn)錄2021年即擁有空間代謝組和空間轉(zhuǎn)錄組（歐易生物）兩個平臺，已執(zhí)行空間代謝+空間轉(zhuǎn)錄聯(lián)合項目10+?？臻g多組學(xué)檢測平臺2套AFADESI-MSI成像系統(tǒng)，分別連接QE或者QE-HF高分辨質(zhì)譜儀。***套AFADESI成像系統(tǒng)（連接Thermo QE高分辨質(zhì)譜儀）第二套AFADESI成像系統(tǒng)系統(tǒng)（連接Thermo QE-HF高分辨質(zhì)譜儀）空間代謝組技術(shù)特點。浙江空間代謝組學(xué)圖片

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以上結(jié)果表明，AFADESI-MSI方法可以直接檢測極性代謝產(chǎn)物，并具有高特異性，能呈現(xiàn)其在大腦微區(qū)分布的圖像。3.在大鼠腦中繪制微區(qū)代謝網(wǎng)絡(luò)圖要了解大腦的結(jié)構(gòu)區(qū)域發(fā)生的復(fù)雜代謝過程，不僅應(yīng)準(zhǔn)確表征代謝物，還要研究其相關(guān)性。從大鼠腦微區(qū)中提取代謝譜進行代謝網(wǎng)絡(luò)重建。從15個微區(qū)提取的MSI數(shù)據(jù)進行峰挑選和峰對齊（圖1F），包括松果體、中腦導(dǎo)水管、腦橋、梨狀皮質(zhì)、延髓、丘腦、紋狀體、海馬、胼胝體、嗅球、大腦皮層、小腦皮層、穹窿、小腦延髓和丘腦。甘肅空間代謝組學(xué)價格

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