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羥甲基化測序高通量測序

單細(xì)胞測序技術(shù)的應(yīng)用:單細(xì)胞測序技術(shù)可以檢測復(fù)雜組織中單個細(xì)胞不同的生物學(xué)特性,這可以極大的幫助我們進(jìn)一步了解細(xì)胞與細(xì)胞之間的差異。"這幾乎就像通過幾顆星星看到了整個宇宙。"哈佛大學(xué)分子和細(xì)胞生物學(xué)教授 Alexander Schier的這句話應(yīng)用在這里也是很合適了。這幅圖正是來自于在2018年4月 Science 雜志發(fā)表的三篇[8-10]來自哈佛醫(yī)學(xué)院和哈佛大學(xué)的研究人員關(guān)于單細(xì)胞基因測序文章中的一幅結(jié)果圖,Alexander Schier教授也是其中一篇文章的作者。這幾篇文章使用多種檢測技術(shù)組合,其中包括對數(shù)千個發(fā)育中的斑馬魚和青蛙胚胎單細(xì)胞測序,在胚胎發(fā)育建議初的24小時內(nèi)追蹤單個細(xì)胞的發(fā)育情況,可以揭示出胚胎細(xì)胞何時何地轉(zhuǎn)變?yōu)樾碌募?xì)胞狀態(tài)和類型并向我們展示了組織和整個機(jī)體從單細(xì)胞發(fā)育的完整歷程。為什么要用單細(xì)胞測序技術(shù)?羥甲基化測序高通量測序

擴(kuò)增子測序,項(xiàng)目介紹:隨著基因編輯技術(shù)(尤其是CRISPR-cas9技術(shù))的發(fā)展,科研人員使用傳統(tǒng)的Sanger測序技術(shù)無法快速有效鑒定基因編輯效率。但是,通過對靶基因區(qū)域附近設(shè)計引物,進(jìn)行PCR擴(kuò)增,并對PCR產(chǎn)物進(jìn)行高通量測序,可以快速高效的獲得目標(biāo)區(qū)域的突變頻率信息,尤其是對低頻突變的檢測效果遠(yuǎn)遠(yuǎn)優(yōu)于一代測序,性價比極高。16S全長分類測序,項(xiàng)目介紹:16S全長測序分析主要是對 16S rRNA基因全長進(jìn)行擴(kuò)增,基于PacBio 測序平臺測序. 相比較二代測序只選擇 1-2 個高變區(qū)進(jìn)行測序,三代可以獲得全長的 16S 序列,更多變異區(qū)信息可以提高物種鑒定的分辨率,還可以提高對于群落組成的鑒定的精度。另外,針對fungus/真核生物,也可以采用類似的辦法,擴(kuò)增ITS/18S全長,進(jìn)行物種分類測序,提高鑒定精度。生工生物 高通量測序組織材料樣品(提取RNA用),請預(yù)先用液氮速凍,然后轉(zhuǎn)移到干冰中運(yùn)輸。

轉(zhuǎn)錄組測序,項(xiàng)目介紹:RNA-Seq,是基于新一代測序技術(shù)的轉(zhuǎn)錄組學(xué)研究方法:首先提取生物樣品的全部轉(zhuǎn)錄的 RNA 并進(jìn)行 mRNA 富集,然后反轉(zhuǎn)錄為 cDNA 后進(jìn)行新一代高通量測序,在此基礎(chǔ)上進(jìn)行短片段拼接組裝,從而獲得一個個單獨(dú)轉(zhuǎn)錄本,進(jìn)而可以對該生物樣品當(dāng)前狀態(tài)的基因表達(dá)狀況有全局了解。對不同階段或部位生物樣品的轉(zhuǎn)錄組進(jìn)行 比較分析,則可以在轉(zhuǎn)錄層面得到基因表達(dá)水平的變化,針對關(guān)鍵基因則可以進(jìn)行代謝通路(Pathway)的構(gòu)建。

微生物基因組重測序(有參):目前越來越多的微生物基因組被解析出來了。從而使得科研工作者們可以對某些物種微生物進(jìn)行進(jìn)行物種進(jìn)化、種群特征、選擇壓力等研究。利用高通量測序技術(shù),對有參考基因組微生物進(jìn)行多個體的基因組重測序,精細(xì)分析其與參考基因組的SNP、InDel、SV等變異信息。微生物基因組從頭測序(無參):對于不斷分離培養(yǎng)微生物的客戶來說,要確定一個菌株是否是新菌株或者新菌種,較快捷的辦法就是,直接進(jìn)行基因組測序。利用高通量測序技術(shù),對這些基因組進(jìn)行高深度測序,然后進(jìn)行基因組組裝,獲得基因組的框架圖或者精細(xì)圖甚至是完成圖。從而可以快速解析其基因組結(jié)構(gòu)、基因功能、進(jìn)化關(guān)系。單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組測序指在單細(xì)胞水平上對 mRNA 進(jìn)行高通量測序和分析的技術(shù)。

真核/原核無參mRNA-Seq,項(xiàng)目介紹;測序使用Illumina Xten平臺,測序原始數(shù)據(jù)質(zhì)控后進(jìn)行拼接,并進(jìn)一步對拼接所得轉(zhuǎn)錄本進(jìn)行功能注釋、CDD、CDS分析,SNP分析,SSR標(biāo)記開發(fā)等分析。在計算基因的表達(dá)量后,進(jìn)行基因表達(dá)差異及差異基因GO、KOG(原核生物為COG)、KEGG功能富集分析,KEGG pathway等分析。對于多個樣本,可進(jìn)行重復(fù)相關(guān)性檢查、共表達(dá)分析、PCA主成分分析。另外,還可以進(jìn)行基因功能互作、蛋白網(wǎng)絡(luò)互作等分析,深入研究基因功能,進(jìn)一步揭示基因間互作網(wǎng)絡(luò)等信息,為研究網(wǎng)絡(luò)調(diào)控機(jī)理提供方向。 什么是KBSeq全質(zhì)粒測序?羥甲基化測序高通量測序

DNA樣品請?zhí)峁╇娪灸z圖,濃度>20 ng/μl,總量一般1~2 μg。乙醇沉淀DNA或凍干DNA,可冰袋運(yùn)輸,不超過3天。羥甲基化測序高通量測序

生工優(yōu)勢:1.生工高通量測序部擁有豐富的樣品處理經(jīng)驗(yàn),日均處理樣品200余例,涵蓋污泥、糞便、海底沉泥、水體濾膜、植物組織、動物組織/細(xì)胞等樣品,省去您處理樣品的繁瑣過程。2.生物信息分析經(jīng)驗(yàn)豐富,可以滿足客戶標(biāo)準(zhǔn)分析到定制分析作圖的需求。且生工一直秉持只要生工已經(jīng)標(biāo)準(zhǔn)化的分析內(nèi)容(以生工分析報告模板為準(zhǔn)),全部無費(fèi)用。3.生工生物擁有生命科學(xué)領(lǐng)域較全的產(chǎn)品及服務(wù)體系,可以承接從分子到蛋白各個層級的實(shí)驗(yàn)項(xiàng)目。一站式解決問題。羥甲基化測序高通量測序

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