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通過蛋白質(zhì)組學分析檢測了經(jīng)M-Exos處理的HBMECs的改變。外泌體***了HBMECs，在0、24和48小時各種基因的表達增加(圖2A)。此外，熱圖分析揭示了不同表達的功能基因，包括與炎癥、細胞增殖、免疫調(diào)節(jié)和血管生成相關(guān)的因素(圖2B-E)。時序分析表明，HBMECs中標記基因的上調(diào)與炎癥因子IL3RA有關(guān)，增殖相關(guān)蛋白CD40和免疫調(diào)節(jié)因子TNFRSF10C(圖2F-H)。作者主要研究外泌體是否促進人腦微血管內(nèi)皮細胞的血管生成能力，因此初步驗證了M-Exos***后血管生成相關(guān)基因的表達。蛋白質(zhì)印跡結(jié)果顯示血管生成相關(guān)基因FlK1和ANGPT1的表達明顯增強(圖2I)。綜上所述，結(jié)果證實了M-Exos誘導(dǎo)了人腦微血管內(nèi)皮細胞的功能改變。蛋白組學研究必看的經(jīng)典綜述。內(nèi)蒙古乙酰化蛋白組學

轉(zhuǎn)錄組學和蛋白質(zhì)組學分析作者通過轉(zhuǎn)錄組學和蛋白質(zhì)組學分析暴露于DON的C2C12細胞的差異基因（DEG）。轉(zhuǎn)錄組學鑒定了2387個DEG，其中72%被下調(diào)。蛋白質(zhì)組學鑒定出402個DEG，其中74%被下調(diào)。GO和KEGG通路富集分析表明，轉(zhuǎn)錄組學DEGs參與了“男性主要性征的發(fā)育”、“骨骼肌肌球蛋白粗絲組裝”和“骨骼肌收縮的調(diào)節(jié)”等生物學過程。**富集的通路是“ECM-受體相互作用”、“人**瘤病毒***”和“蛋白質(zhì)消化吸收”。蛋白質(zhì)組學分析中，富集到了“肌肉收縮”、“中間絲解聚”和“脂質(zhì)轉(zhuǎn)運”等生物學過程。細胞成分中富集到“細胞骨架”、“細胞外基質(zhì)”和“整合素”。KEGG通路富集到“新霉素、卡那霉素和慶大霉素生物合成”、“系統(tǒng)性紅斑狼瘡”、“ECM-受體相互作用”和“蛋白質(zhì)消化和吸收”。前兩條通路與上調(diào)的DEG相關(guān)，而后兩條通路與下調(diào)的DEG相關(guān)，這與轉(zhuǎn)錄組學結(jié)果一致。內(nèi)蒙古靶向定量蛋白組學單細胞蛋白質(zhì)組學，極微量樣本檢測。

運用生物技術(shù)：磷酸化蛋白質(zhì)組學（歐易鹿明提供）：2022年1月，***醫(yī)學研究院生物工程研究所鐘輝研究員、魏從文副研究員和秦成峰研究員，廣西醫(yī)科大學附屬**醫(yī)院吳飛翔教授等為共同通訊作（一作：萬祿明、鄧永強、柯躍華、麻恩浩、楊歡、林浩天）在Nature Metabolism期刊發(fā)表的題為“GP73 is a glucogenic hormone contributing to SARS-CoV-2-induced hyperglycemia”的研究成果，通過磷酸化蛋白質(zhì)組學、LC-MS靶向代謝組學等研究方法，發(fā)現(xiàn)了一個全新的糖異生調(diào)控***——GP73，***會誘導(dǎo)GP73的產(chǎn)生和分泌，從而導(dǎo)致過度的糖異生。

iTRAQ標記定量蛋白組學技術(shù)鑒定AHSG和RPL29分別是上調(diào)和下調(diào)*****的蛋白。301份肝*標本的統(tǒng)計分析表明AHSG與NMT1呈正相關(guān)，而RPL29與NMT1呈負相關(guān)（圖8A）。此外，NMT1和AHSG均與**分期正相關(guān)，而RPL29與肝*的**分期呈負相關(guān)（圖8B）。值得注意的是，NMT1和AHSG水平較高的肝*患者的生存率低于水平較低的肝*患者（圖8C）。而較高水平的RPL29表明存活率較高（圖8C）。這些數(shù)據(jù)表明NMT1、NUP和NDP與肝*的臨床結(jié)果密切相關(guān)。iTRAQ蛋白質(zhì)組學技術(shù)鑒定NMT1敲除時發(fā)生變化的蛋白質(zhì)；TMT/iTRAQ標記定量蛋白組學 差異表達蛋白質(zhì)組分析研究。

蛋白質(zhì)組數(shù)據(jù)分析鑒定出了幾種參與肝葡萄糖脂代謝的蛋白質(zhì)（ACC、FASN、SCD1、CPT1A、GLUT2、GK、GS、G6Pase、PEPCK）。此外，AC顯示出抑制脂肪生成酶（ACC，F(xiàn)ASN和SCD1）表達的趨勢，同時***上調(diào)了GLUT2。與對照組相比，AC***增加了PEPCK的表達，兩種化學物質(zhì)對G6Pase均無***影響（圖4A）。PRM蛋白靶向驗證測定結(jié)果與蛋白質(zhì)組變化相一致，這進一步證實了蛋白質(zhì)組學數(shù)據(jù)中蛋白質(zhì)的表達（圖4B）。轉(zhuǎn)錄組學和蛋白質(zhì)組學聯(lián)合分析結(jié)果顯示AC和AL***改善了線粒體功能。GSEA分析顯示，處理組的氧化磷酸化（OXPHOS）通路***上調(diào)，AC組和AL組的富集得分分別為0.826和0.535。蛋白組學常見研究模式 | 蛋白質(zhì)組專題_鹿明生物。內(nèi)蒙古乙?；鞍捉M學

蛋白組學，研究方法，高通量定性定量研究,有。內(nèi)蒙古乙酰化蛋白組學

本文為了探究其潛在的分子機制，作者運用RNA測序（RNA-seq）和iTRAQ標記定量蛋白組學，對不同成熟度水平的油脂種子進行了研究。不僅揭示了關(guān)鍵候選基因和蛋白質(zhì)的時間特異性表達，而且為該樹種的遺傳改良提供了科學依據(jù)。中文標題：基于iTRAQ蛋白質(zhì)組學和轉(zhuǎn)錄組學聯(lián)合分析揭示油茶種子成熟過程中油質(zhì)相關(guān)的關(guān)鍵代謝產(chǎn)物的積累研究對象：油茶種子發(fā)表期刊：HorticultureResearch影響因子：6.793發(fā)表時間：2021.07.01發(fā)表單位：海南大學園藝園林學院運用生物技術(shù)：RNA測序(RNA-seq)和iTRAQ標記定量蛋白組學、轉(zhuǎn)錄組學、蛋白組學文章中iTRAQ標記定量蛋白組學由歐易/鹿明生物提供技術(shù)支持內(nèi)蒙古乙?；鞍捉M學

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