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蛋白質(zhì)組學技術研究案例：作為一種常見的******，脫氧雪腐鐮刀菌烯醇(DON)在田間或加工和儲存過程中會污染谷物和飼料。DON在動物中會引起厭食和生長遲緩在內(nèi)的一系列不良反應。本文作者使用轉(zhuǎn)錄組學和蛋白質(zhì)組學技術對鼠C2C12細胞進行了研究，分析DON對成肌細胞分化的影響。研究結果表明，DON通過下調(diào)細胞骨架和ECM-integrin-FAK-RAC-PAK信號通路來影響成肌細胞的分化。本文研究體現(xiàn)了組學技術在機制研究中的重要作用。中文標題：霉菌***脫氧雪腐鐮刀菌烯醇通過下調(diào)細胞骨架和ECM-integrin-FAK-RAC-PAK信號通路影響成肌細胞分化研究對象：脫氧雪腐鐮刀菌烯醇、C2C12細胞發(fā)表期刊：EcotoxicologyandEnvironmentalSafety影響因子：6.291發(fā)表時間：2021年10月發(fā)表單位：中國科學院上海營養(yǎng)與健康研究所運用生物技術：轉(zhuǎn)錄組學和蛋白質(zhì)組學(由歐易/鹿明生物提供技術支持)、免疫熒光、免疫印跡、PCR修飾蛋白質(zhì)組試-蛋白質(zhì)組學 解決方案。吉林蛋白組學質(zhì)譜數(shù)據(jù)分析

作者通過泛素化蛋白組學分析鑒定了茶樹作根中的泛素化蛋白質(zhì)。中文標題：氮調(diào)節(jié)茶樹根中茶氨酸和黃酮類化合物的生物合成：多組學分析揭示的蛋白質(zhì)水平調(diào)節(jié)研究對象：茶樹根發(fā)表期刊：JournalofAgriculturalandFoodChemistry影響因子：5.279發(fā)表時間：2021年9月1日發(fā)表單位：安徽農(nóng)業(yè)大學運用生物技術：TMT蛋白質(zhì)組學、泛素化蛋白質(zhì)組學(其中部分數(shù)據(jù)分析由鹿明生物提供技術支持)。本文分析了氮缺乏下茶樹根部的茶氨酸和黃酮類代謝，通過蛋白質(zhì)組和泛素化蛋白質(zhì)組結合轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)探索了調(diào)節(jié)機制。本文的多組學數(shù)據(jù)整合分析思路值得借鑒。江蘇磷酸化定量蛋白組學蛋白質(zhì)組學,蛋白質(zhì)組分析,專業(yè)的多組學聯(lián)合分析。

蛋白質(zhì)組學、磷酸化蛋白質(zhì)組學研究案例：2021年12月30日復旦大學附屬中山醫(yī)院樊嘉院士、中國科學院上海藥物研究所周虎研究員、中國科學院分子細胞科學***創(chuàng)新中心高大明研究員、復旦大學附屬中山醫(yī)院**教授課題組合作在Cancer Cell上發(fā)表題為“Proteogenomic characterization identifies clinically relevant subgroups of intrahepatic cholangiocarcinoma”的研究論文，通過基因組學、轉(zhuǎn)錄組學、蛋白質(zhì)組學、磷酸化蛋白質(zhì)組學、微生物組學研究方法對262例肝內(nèi)膽管*（iCCA）患者的配對**和*旁組織進行了分析，通過繪制肝內(nèi)膽管*的多維分子圖譜為進一步鑒定iCCA的分子發(fā)病機制、分子分型、預后等提供了寶貴的資源。

4D蛋白組學：tims TOF Pro2依賴于雙捕集離子淌度（TIMS）和同步累積連續(xù)碎裂（PASEF）數(shù)據(jù)采集模式兩大創(chuàng)新技術，可實現(xiàn)快速采集、更高的靈敏度和特異性。同時，其配備了***一代雙 TIMS 分析器，離子容量可提高三倍，比較大限度地提高了離子傳輸效率和靈敏度，讓蛋白質(zhì)組學分析再上一個新的臺階，鹿明生物同時配備了Evosep One高通量色譜使其在短梯度下也能實現(xiàn)蛋白深度覆蓋，結果更精細，也成為轉(zhuǎn)化組學應用不可或缺的工具。更高掃描速度：助力臨床大隊列項目研究，更高覆蓋深度：助力蛋白組鑒定到更多的蛋白數(shù)量，超高靈敏度：助力微量樣本蛋白組分析，鑒定更可信：助力蛋白或化合物更高可信度的鑒定。蛋白組學檢測一個樣多少錢。

為了確定TMT AD蛋白網(wǎng)絡模塊是否也存在于其他的隊列和大腦區(qū)域，使用 TMT標記定量蛋白質(zhì)組學多個隊列的所有組織，為每個隊列生成蛋白質(zhì)共表達網(wǎng)絡，并評估了 AD 網(wǎng)絡模塊是否保留在每個隊列和大腦區(qū)域中。發(fā)現(xiàn)幾乎所有的 TMT AD 網(wǎng)絡模塊都保留在隊列和大腦區(qū)域（圖2b）。阿爾茨海默病(AD)是一種神經(jīng)系統(tǒng)退行性疾病，其病因至今尚不清楚。本文從蛋白組學方向出發(fā)，建立蛋白共表達網(wǎng)絡，綜合轉(zhuǎn)錄組學結果，解析疾病相關的蛋白組學模塊或能為AD提供可靠的生物標志物，并為治療帶來希望。蛋白組學問題解答知乎都做不到哦。廣東蛋白組學服務

TMT/iTRAQ標記定量蛋白組學 差異表達蛋白質(zhì)組分析研究。吉林蛋白組學質(zhì)譜數(shù)據(jù)分析

單細胞蛋白組學研究方法：2020年9月，加州大學的MinnieM.Sarwal課題組在FrontiersinMedicine發(fā)表的題為“Near-Single-CellProteomicsProfilingoftheProximalTubularandGlomerulusoftheNormalHumanKidney”的研究成果，通過單細胞蛋白組學研究方法，分析正常人近端腎小管和腎小球區(qū)域的腎臟細胞，研究為解開急性和慢性腎臟疾病病因和腎臟亞細胞功能擾動提供依據(jù)。中文標題：正常人腎臟近端腎小管和腎小球的單細胞蛋白質(zhì)組學分析研究對象：人體腎臟組織發(fā)表期刊：FrontiersinMedicine影響因子：5.091發(fā)表時間：2020年9月運用重點組學技術：單細胞蛋白質(zhì)組學技術吉林蛋白組學質(zhì)譜數(shù)據(jù)分析

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